台湾从美国进口很多农产品，未来若遇到疫情或特殊情况，当任何一方要限制出口时，在不伤害贸易规则前提下，必须早点通知。 记者叶信菉／摄影
相较于「台美21世纪贸易倡议」第一阶段的顺利开场，不少学者认为第二阶段的农业、劳动和环境议题已跨入「深水区」，预期谈判将更复杂。
中央大学经济系教授邱俊荣直指，农业议题在所有经贸谈判中，都是各国最敏感的问题。他举例，当初美国在主导「跨太平洋战略经济伙伴关系协定」（TPP）时，日本完全不想加入，因为美国是农业大国，如果一开放，日本人担心整个既有的农业无法承受，还一度流行「TPP亡国论」，拒绝TPP。