国防部表示，现行禁止限制水域执法任务，由海巡署负责，国军依据海岸巡防机关与国防部协调联系办法及海上任务综合支援协定书提供支援，透过双方联合情监侦平台，加强横向协调联系，共同监控台湾周边中共舰船军事、非军事活动及海上兵力部署动态，研判后续可能行动，相互通报支援，协同应处。

国防部是在答复国民党立委罗智强书面质询时，作了以上表示。罗智强说，金门海域发生大陆渔船违法越界捕捞，遭海巡署值勤船只执行驱离公务时，发生碰撞造成两名大陆籍渔民意外落水身亡，后续衍伸金门海域管辖权与执法行动，牵涉两岸关系变化，受社会大众瞩目。

国防部表示，依台湾地区与大陆地区人民关系条例第29条第1项规定，大陆船舶、民用航空器及其他运输工具，非经主管机关许可，不得进入台湾地区限制或禁止水域、台北飞航情报区限制区域；同条第2项规定，前项限制或禁止水域及限制区域，由国防部公告之。国防部民国81年10月7日依据两岸条例规定，画设限制禁止水域，且历经公告修正迄今，双方执法机关均依此进行相关水域执法工作，多次展开执法及海上救难合作。

国防部说，依两岸条例第32条第1项规定，大陆船舶未经许可进入台湾地区限制或禁止水域，主管机关得迳行驱离或扣留其船舶、物品，留置其人员或为必要之防卫处置。现行禁止限制水域执法任务，由海巡署负责，国军依据海岸巡防机关与国防部协调联系办法及海上任务综合支援协定书提供支援，透过双方联合情监侦平台，加强横向协调联系，共同监控台湾周边中共舰船军事、非军事活动及海上兵力部署动态，研判后续可能行动，相互通报支援、协同应处。一经发现异常，海巡署视况依相关标准作业程序及各类突发状况处置原则即时应处，同步通报陆委会，透过两岸联系管道加强与陆方沟通，避免造成误判、冲突及情势升温，确保两岸关系和平稳定。