黑尾鸥近年常在日本东京都内东京湾与隅田川附近地区的大楼与公寓等地筑巢，当地政府频频接获民众抱怨遭鸟叫声与粪便「骚扰」，甚至有民众因此「彻夜难眠」。

日本「读卖新闻」报导，东京都江东区1名男子经营的诊所位在隅田川附近，他提到近年来聚集在当地的黑尾鸥就厌烦地说：「一想到今年又要听到吵杂的鸟鸣声在大楼之间回荡以及遭遇大量的鸟粪，就觉得累人。」

黑尾鸥数年前起飞到隅田川附近，不管白天或夜晚常发出鸟叫声，让居民不堪其扰。民众指出，「有人因此身心俱疲，严重影响居民生活环境」。

根据江东区公所，确认大量黑尾鸥飞至当地是2015年的事情，且牠们偏好栖息在约10层楼高的绿化建筑物屋顶，因此鸟巢与鸟蛋也常出现在这些地方。

江东区公所调查，接获相关陈情的数量从2014年度的3件，暴增到2022年度的197件，陈情内容包含「鸟粪弄脏洗好的衣物」，或是「因为尖锐的鸟叫声彻夜难眠」。

由研究野鸟专家组成的「都心黑尾鸥研究会」等单位研判，黑尾鸥喜欢栖息在隅田川周边，是因为附近高楼距离河水非常近，可能跟喜好的栖息环境相似有关。

东京都环境局处理相关业务的人员对此叹气地说：「起初是为了考量环境（推动绿化高楼层建筑物），不过现在这些建物却成为黑尾鸥筑巢的地点。」

除了江东区之外，东京都墨田区、台东区、中央区、千代田区也出现被黑尾鸥影响的案例。都政府从各区公所搜集资讯后，2021年度开始与专家研议因应对策。

根据日本的法规，鸟巢并非生物，因此建物的管理者等人可以摘除，不过「鸟兽保护法」禁止随意捕获黑尾鸥或是采集黑尾鸥鸟蛋。

对此，东京都政府2022年4月修订「鸟兽保护管理事业计划」，开放让特定业者等在黑尾鸥繁殖期的3月至8月，于东京23区内摘除黑尾鸥的鸟巢与移走雏鸟。根据这项计划，2022年度已经移除约30只雏鸟、约600颗鸟蛋。

墨田区公所过去9年接获的相关陈情暴增3倍，今年3月开始补助摘除费用；江东区公所2023年度在部分地区发放传单，宣导民众可以在屋顶装防虫网等防止黑尾鸥筑巢。

江东区环境保全课课长佐藤生男指出：「若能引导黑尾鸥至东京都以外栖息当然比较好，但是很难改变鸟类的行为，呼吁民众尽早做好准备。」