根据「民报」报导，鸡蛋风暴后，进口蛋销毁拖延，多花纳税人超过8千万元，农业部表示，2023年整年专案进口鸡蛋仓储费用包括壳蛋、加工蛋品及过期鸡蛋，其中农业部补助近一半约4116万元，并由中央畜产会自付4284万元，并无多花纳税人8千万。

农业部指出，去年计划补助中央畜产会办理过期进口鸡蛋堆肥化处理，以有效利用作为有价的堆肥，已于去年底决标。堆肥化处理作业已于今年3月11日启动，原订处理期程在120日内完成，为节省仓储费用，农业部督导畜产会加紧处理中。

根据农业部统计，迄今已处理7成以上共4234万颗，已将期程目标缩短，剩余1346万颗预计4月下旬完成。

农业部代理部长陈骏季强调，报导里指鸡蛋要到今年7月底才销毁为错误讯息，起初因堆肥场无堆肥许可而无法顺利开始，之后农业部便积极助其取得许可，预计4月下旬就能全数完成堆肥化，比在3月时于立法院承诺5月底前销毁的时程早了整整1个月。