台湾媒体报道，在陆委会主委人选方面，已内定由海基会副董事长兼秘书长邱垂正出任。

亲绿的《自由时报》星期四（4月11日）报道，知情者称，邱垂正的中选象征新政府采取和平务实路线的极大可能性。

据报道，邱垂正长期在中国大陆事务领域历练，曾任陆委会副主委兼发言人长达七年多，历经张小月、林正义（代主委）、陈明通、邱太三担任主委的时期，并在金门大学教授相关领域学门，为民进党长期培养的政学两栖、学养与实务兼备的年轻人才。

邱垂正在学界期间经常往返中国大陆交流访问，形象温和，不卑不亢，保留与对岸对话的空间，并建立若干人脉。

现任陆委会主委邱太三计划返回学校任教。

台湾总统当选人赖清德星期三（10日）正式宣布，民进党前主席卓荣泰将在5月20日出任新政府的行政院长。 他称赞卓荣泰长于沟通、善于协调，期许卓荣泰能打造“行动创新的AI内阁”。

卓荣泰随后也对外介绍未来将出任副行政院长的郑丽君、行政院秘书长龚明鑫和行政院发言人陈世凯。