日本读卖电视台报导，日本当地时间5日下午4时（台湾时间同日下午3时）左右，一列抵达JR京都站的列车上发现可疑物品，当地警方后来虽确认该物无安全疑虑，但京都站发车、停靠的地方线路（在来线）电车仍一度停驶。列车营运已于当地下午6时重启。

报导引述当地警方指出，车站人员当时在该列车上发现可疑背包，该背包外侧标记有疑似化学药品的名字。鉴于可能是可疑物品，警方还出动防爆处理小组。经确认后，背包里面为衣物，并未发现异常。

由于这起事件，JR西日本一度限制京都站的人员出入，并暂停京都站出发、停靠的地方线路列车营运。另一方面，京都站发车及停靠的东海道新干线、近铁线、地铁线列车等照常营运。

另据部分媒体释出的现场影像可见，事发车站出现大量人潮。