前总统陈水扁因贪污案判刑确定、目前保外医治，外传有来自党政方面消息指出，蔡英文总统有意启动对扁的特赦案。法律规定，一旦蔡英文想特赦陈水扁，行政院法律顾问机关即法务部要研议出特赦案「有无伤害司法」的报告上呈。

赦免法分大赦、特赦、减刑、复权四种型式，大赦是对刑之宣告的人让其追诉权及时效全部消灭，特赦是针对刑事判决确定的人予罪或刑的法律宽典，另，减刑于2007年由前总统陈水扁时代执行一次，复权罕为应用。

特赦是现任总统的专属权力，依法律规定，总统要启动特赦应经由行政院令转主管部务部研议特效对国家、社会一切可能的冲击。

特赦案件分2种型态，其一，是免除个人刑责的执行，罪名犹在，另一种型态是考量犯罪情节如果确有特殊原因，可以宣告确定判决包括「罪与刑」均无效。

法务部如受命研议「扁案」的特赦影响，必须作出可行性评估，内涵以对社会的「衡平性」为考量，要以陈水扁所犯贪污罪与别的贪污犯有无相类似情节，换句话说，如果扁可以免刑、免诉，其他贪污犯可否比照？法务部须有建议。

此外，法务部研议时，还须注重特赦执行对国民情感、社会舆论的影响，尤其，特赦推翻的是既定的司法确定判决，有凌驾于法律之上的效果，因此，法务部必须陈明特赦案是否对司法产生伤害。

特赦案的研议流程与非常上诉、再审不一样，非常上诉、再审要遍阅全部案卷找出侦审经过未察觉的新事实、新证据，求判决翻盘；特赦案是以判决书为研究基础，得出个人犯情、所生危害等客观因素，再评价出特赦的利与弊。

根据赦免法，经总统命令特赦、减刑或复权者，由主管部发给证明于受赦免人。法务部表示，目前并没有收到府方的研议或发给证明的要求。