继海军司令部在屏东县牡丹乡九鹏基地兴建岸置鱼叉飞弹阵地，未依原住民基本法召开部落咨商同意会就施工，引爆部落居民怒火停工后，地方不满国军地方睦邻工作要点未考量训场规模大小，广达1600公顷的九鹏基地，却和1公顷的训场标准相同，周边牡丹和满州2乡长透过立委要求国防部检讨修改，并删除分摊性质的中科院「二房东条款」，中科院及各军种应分项计算，保障人民因演训受限的权利。

中科院九鹏基地是我国最重要的飞弹测试场，基地横跨屏东县牡丹乡旭海村和满州乡港仔村，国军依国军主要武器训练场及油料弹药库影响地方睦邻工作要点，因每年演训天数超过百天，对2乡各发放影响最高级别、每年1100万元的睦邻回馈金；但牡丹乡公所最近得知，九鹏基地每年给地方的2200万元中，2000万却是国防部出的，引爆「那中科院给地方什么？」不满，向立委伍丽和徐富癸陈情，军方说明是依要点第33条规定。

牡丹乡长潘壮志和满州乡长古荣福指出，现行国防部睦邻工作要点，是以陆、海、空军司令部和军备局各单位分项办理，各地有不同军种司令部，各别训场办理睦邻作业，唯独中科院以各军种共同依比例分摊方式办理，形成每年三军不同军种进驻演训，所在地两乡却从未获得各军种睦邻经费的不公平、不公义情形，要点第33条形同「歧视」九鹏基地所在地牡丹和满州两乡的不平等条款。

2人强调，全民支持国防，但人民生活权益受演训影响理应获补偿而非补助，国防部「关起门来」自订的睦邻工作要点，却限制回馈金用途，受限居民对回馈无实质感受产生民怨；另九鹏基地陆地面积达1600公顷，加上海域管制面积，但要点评定项目，面积并未酌增额度，上千公顷和1公顷训场用同一标准，造成不同军种小规模训场的乡镇，回馈总额度却比面积最大牡丹、满州两乡还高的不合理现象，应修改并删除分摊条款。

要点33条规定，中科院九鹏训场睦邻补助，依该院睦邻审议会审定额度核实拨发补助经费并执行，国防部得按核定国军委托该院执行研发、测试实施实弹射击的管制日数，依使用者付费原则，比例分摊费用。

军方说，要点不合理处，会和地方持续沟通检讨改进，至于分摊机制，国防部每年编列近2000万委托中科院做睦邻，去年修订时本要删掉，但相关配套没有很完善未删。中科院副院长罗意中说，修订要分开处理，中科院已做好准备。