绿色和平盘点台湾6大海洋观光区沿近海的海上活动，发现含小琉球的大鹏湾为生态压力最高的前3名；中山大学海洋研究所教授张水锴说，小琉球登岛游客除疫情期间外年破百万，观光热潮带来的游憩压力，是冲击海洋生态主因，县府7月起收每人60元观光保育费，虽只是跨出保育一小步，却是好的开始，立法院应加速审查海保法，建立长期监测与管理系统维护海洋生态，创造生活、生态、生计三赢。

屏东县政府2019年起委托中山大学海洋事务研究所调查研究，发现在观光蓬勃发展和气候变迁下，小琉球潮间带海洋生物较过去明显衰退，县府隔年起在杉福、渔埕尾、肚仔坪3处自然人文生态景观区潮间带，实施人流管制等保育措施。

去年再委托中山大学调查，发现3处潮间带大型底栖无脊椎动物密度，虽有稳定回升，但恢复速度缓慢；张水锴说，垃圾、民生污水和废渔网都是人为产生，要在发展观光和生态保育间找到平衡点，海洋保育教育宣导外，正在审查海保法很重要。

国立海生馆研究员樊同云观察，旺季时小琉球各浮潜点人多到像「下水饺」、潮间带如「贪食蛇」，海洋生态经不起经年累月的踩踏摧残，加上岛上民生污水、废渔网和气候异常引造成珊瑚白化，全岛珊瑚系生态大幅衰退，甚至已到「失能」程度，近年借由人工复育只是杯水车薪，还好岛上海洋保育志工投入净滩和净海，县府管制潮间带人流，不致恶化，若不能像垦丁依国家公园法划设禁入的海洋资源生态保护区，至少要做好生态监测和人数管控。

南台湾潜水观光热点的屏东垦丁也被绿色和平「点名」海洋栖地持续受破坏，并端出珊瑚衰败、废弃渔网缠绕生物与珊瑚、垃圾累积的证据；长年投入环境永续公益活动的台湾潜水公司执行长陈琦恩说，垦丁每年涌入数百万游客，带来庞大的垃圾，还有渔民捕鱼的渔网，不可能要求每个人都守法，出现在海底不意外，喜的是净海观念渐普及，教练带学员导潜时都会捡拾，加上受国家公园法保护，垦管处也长年监测和管理，状况一天比一天好。