InfoQ 推荐 ( ) • 2021-10-14 14:55
与依靠穷举法搜索稳定mRNA序列的思路不同,LinearDesign通过动态规划算法,将序列稳定性和蛋白质翻译效率指标进行联合优化,可在10分钟内找到比天然序列更加稳定且蛋白质表达水平更高的新冠mRNA疫苗序列,实现了在最短时间内用最高的效率得出最优化的方案。
本次实验研究基于LinearDesign算法设计的七条编码新冠病毒刺突蛋白的mRNA疫苗序列,对这些mRNA分子的稳定性、编码蛋白表达水平以及动物免疫原性等方面开展了深入研究,并与用传统方法设计的基准mRNA序列进行了头对头的对比。
近日,百度和斯微生物联合公布了mRNA疫苗序列设计算法LinearDesign的新冠病毒疫苗生物实验结果:在稳定性、蛋白质表达水平以及免疫原性等多个衡量疫苗的重要指标上,LinearDesign设计的新冠疫苗序列均大幅优于传统方法设计的基准序列,尤其在抗原中和抗体滴度这一衡量疫苗有效性的关键指标上,LinearDesign设计的序列最高超过基准序列达到20倍,表示LinearDesign设计的疫苗能够有效产生免疫保护 ... 阅读全文