台湾高铁公司表示，受0403花莲大地震影响，采降级运转，并宣布自上午11至下午1时间，改以每20分钟自南港站及左营站，分别发出一班全车自由座列车(第六节商务车厢除外)以疏运旅客，上述时段(以端点站发车时间为准)原时刻表各车次取消。
此次地震高铁受影响路段超过275公里，且部分路段测得3级地震告警，依台湾高铁地震应变标准作业程序，维修人员需配合随乘巡检及轨道之动摇测试，且列车通过受影响区域须先以注意进行方式(时速45公里以下)运转，后续再分别以时速70公里、120公里、170公里、230公里之顺序，渐进提升运转速度，目前巡检作业仍在持续进行中，敬请旅客耐心等候。
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此事件致部分列车取消，台湾高铁公司除加开全车自由座列车因应外，也同步于车站及列车加强对旅客广播，说明延迟情形，同时在车站提供饮用水及面包供旅客取用，后续最新营运讯息，将尽速对外公布。