《消逝的光芒》的故事起初显得相对平静，然而随着拉辛之死，情节开始逐渐紧张起来。现在，泽雷博士被俘，他的命运悬而未决，克兰面临着如何解救塔楼危机的难题。
消逝的光芒
承接上篇剧情：
困兽
在探索解药的道路上刚刚取得一些成果时，泽雷博士被赖斯绑架了。每当克兰想到拉辛坚定的决心时，他的内心就充满了愤怒。他毫不犹豫地拿起武器，直接冲向赖斯的据点。
令克兰意外的是，仅仅是地下室的入口就有十多名守卫。然而，这些守卫怎么可能是一个训练有素的特工的对手呢？经过一场激烈的交火，克兰成功击溃了他们，并最终找到了被囚禁的泽雷博士。从博士那里，克兰得知杰德已经先行一步前往旧城区。正当克兰准备带泽雷博士离开时，他们不慎落入了赖斯设下的陷阱。赖斯早已预料到克兰会来救博士，而他绑架博士的目的只是为了得到研究资料。既然目的已经达到，克兰他们对他来说就没有价值了。因此，他命令手下将克兰击晕......
当克兰恢复意识时，他发现自己置身于一个竞技场中。空气中弥漫着丧尸的腐臭气味，而赖斯等人则在高架上远远地注视着克兰。竞技场的丧尸见一个人类的闯入，变得异常兴奋。此时，克兰的武器已经被赖斯等人拿走，赤手空拳显然无法与丧尸群抗衡。就在丧尸即将扑向克兰的危急时刻，他迅速抓起地上的柴刀，猛地进行反击。幸运的是，克兰利用地形优势，凭借自己的硬实力和跑酷技巧，艰难地解决了所有的丧尸。
游戏截图
赖斯的脸上先是露出了惊讶的神情，但几乎在同一时刻，他迅速收敛了情绪。他对克兰的表现表示出了高度的认可，所以在生命的最后时刻赖斯向克兰透露了病毒研究的秘密病毒研究的秘密。原来，GRE之所以援助哈兰市，是因为这种病毒正是由他们泄露的。他们既想要研制出解毒剂，同时也希望观察病毒在哈兰市引发的各种变化，以便将此作为生化武器生化武器的开发利用。这番话让克兰震惊不已，内心深处充满了无力感。正当赖斯命令手下消灭克兰时，克兰却突然爆发出惊人的潜能。在士兵即将扣动扳机的瞬间，他果断反击，成功击倒了两名赖斯的部下。紧接着，在赖斯还未完全反应过来并试图对克兰开枪的一刹那，克兰以柴刀猛砍下了赖斯的手臂，随后他敏捷地攀上高架，成功地找到了被绑架的泽雷博士。
泽雷博士在生命的最后一刻，虚弱地请求克兰坚守正义，援助那些无助的人们。话音刚落，他便离世了。面对紧迫的危机，克兰抑制住心中的哀伤，急忙逃离现场，身后响起了赖斯愤怒的咆哮声。
泽雷博士的嘱咐
旧城区
克兰带着沉重的挫败感返回塔楼，向布雷肯汇报了泽雷博士的不幸离世。在与布雷肯进行了简短的对话后，他决定立刻前往旧城区前往旧城区寻找救命恩人杰德。他深知自己还未能回报她的恩情，如今又让她卷入了他弟弟的悲剧之中，这令克兰心中充满了担忧。
对于GRE，克兰已经彻底失望，他终于能够理解为何之前会有同事选择背叛组织。他找到了一些愿意引领他们通过下水道进入旧城区的人，但他没想到这些人竟然甘愿成为赖斯的走狗。然而，凡是与他作对的人都没有好下场，最终都被他一一制服。克兰顺利地来到了旧城区。
在之前替赖斯修复无线电的时候，一个名叫特洛伊的女孩特意通过无线电向他表示感激。特洛伊和其他一些人就在旧城区，他们已经联系了克兰，并且很快与他会面。他们位于旧城区一座即将完工的最高钟楼上。
从特洛伊那里，克兰得知杰德确实也来到了旧城区，但她并不愿意见他。此时的杰德还未从她弟弟去世的阴影中走出来。
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赖斯此前对外揭露了GREGRE的恶劣行为，引发了公众对GRE的广泛抵制。这种抵制为军方提供了强大的后盾，并赋予了他们更大的发言权。他们宣称哈兰市已无生还者，并计划派遣战斗机进行轰炸，旨在将病毒彻底消除在哈兰市内。
特洛伊向克兰提出了一个避免被炮轰的办法：向外界发出信号，显示城市中仍有生命的存在。他们的计划是在一座废弃的大楼顶部炸出一个巨大的标志，以吸引外界注意。考虑到危险性，这个任务自然落在了身为特工的克兰身上。
对于克兰来说，连夜潜入怪物的巢穴或穿越满是僵尸的走廊不过是家常便饭。他迅速完成了任务，并在逃离大楼的一刻启动了遥控炸弹。爆炸瞬间形成了一个巨大的“X”形图案。然而，几乎在同一时刻，军方的战斗机飞过，将这一图案摧毁，可以看出出军方掩盖真相的决心和效率。克兰对军方的行为感到愤慨，但最终也无能为力。
幸运的是，杰德理解了克兰想要救援幸存者的用心，并通过无线电与克兰取得联系。然而，当克兰按照约定到达小屋时，并没有找到杰德，只发现了赖斯等人留下的信息。显然，赖斯通过窃听了解了他们的计划，并提前一步绑架了杰德。现在，杰德正被困在博物馆，等待克兰前去营救。
轰炸的大楼
诀别
这显然是赖斯布下的一个圈套，就看克兰是否愿意冒险。然而，他又怎能明白克兰明知山有虎偏向虎山行的决心呢？
尽管博物馆早已被赖斯帮派的成员所控制，但面对强大的克兰，他们却束手无策。最终，他们只能成为克兰的枪下亡魂。
然而，当克兰终于找到杰德时，她却即将发生异变。赖斯站在阳台上嘲讽着克兰无法拯救一切。原来之前所有给克兰设计的障碍都是为了拖延时间，以便诱发克兰的癫痫癫痫。现在两人都将面临变异，赖斯从阳台扔下一支解毒剂，让他们自己做出选择。但这无疑是一种杀人诛心的手段，活着的人必须杀掉变异的人。
杰德仍在劝说克兰使用药剂，因为只有他才能拯救大家。克兰感到迷茫，这是他第一次真正陷入困境。因为他，杰德的男友死了；同样也是因为他，杰德的弟弟也离世了。如今杰德却要求他亲手杀掉自己，他又怎能下手？一次次的癫痫发作刺激着大脑，就在克兰感觉即将变异的时候，他进入了一个奇怪的空间。在那里，他不断追逐着杰德，但她却在他的眼前不断消失重现。过去发生的一幕幕都在眼前回放，但他却无法抓住任何东西。耳边传来杰德的声音，她告诉克兰她已经原谅了他，并且她已经明白每个人的牺牲都是有价值的。这一次她自己也同样会牺牲自己以换取克兰拯救哈兰的机会。
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克兰跟随杰德来到最后一处，杰德不再说话背对着他。他想接近杰德说些什么，只见杰德猛地一回头，此时的她已经变成了丧尸。她冲过来想要攻击克兰，但克兰一把掐住她的脖子却发现她已经将解毒剂扎在了他的身上。这让克兰恢复了神智，而杰德也终于支撑不住了。然而，赖斯这个恶人派出几名士兵想要连克兰也一同带走。杰德趁着最后的理智杀掉了所有前来的士兵，在最后一刻完成了转变。她冲向了克兰，而克兰只是狠心地扭断了她的脖子，亲手送走亲自送走了他的救命恩人。
赖斯见状请来自己最得力的部下与其交战，可其实他的本意就是掩护自己离开，只能说赖斯真的苟。果不其然不到三个回合，他的部下就败下阵来，克兰也从他那里得到了研究研究解药的样本，这样就算是没有得到研究资料也算是有了解决方案。
尸变的杰德
余晖
随着军方轰炸行动的临近，特洛伊不得不构思了一个备选方案。她指示克兰必须前往城市中最高的通讯塔，并在那里发送信号，这种信号强大到足以超越军方的封锁，从而向外界传达哈兰内部的实况。然而，这同样是一次冒险，他们赌的是军方在公众压力下不会采取过于激进的行动。
这项艰巨的任务自然而然地落在了克兰的肩上。克兰没有推辞，在克服了一系列困难后，他终于登上了城市中最高的通讯塔，迅速向外界传递了哈兰尚有幸存者的关键信息。就在此时，军方的战斗机已经清晰可见，但它们只是在哈兰市上空飞过，并未进行任何攻击，这表明特洛伊的计划奏效了。但克兰还来不及感到高兴，GRE组织的成员就通过无线电联系他，希望他能不计前嫌协助组织夺回资料。但克兰哪里听得进去这些，他愤怒地斥责了几句后，便切断了与GRE的联系。
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克兰一回到地面，立刻将生物样本交给了卡姆登博士，希望尽快得到解药。幸运的是，生物样本依然存
存活，这意味着还有机会。这使得克兰的心情终于得以平复。然而就在这时，他接到了赖斯的无线电通话。赖斯声称已经决定将研究文件交给GRE，作为交换，GRE将派直升机将他送走。尽管赖斯本可以悄悄离开，但他却选择打电话嘲讽克兰。
这种挑衅让克兰难以忍受，他立刻冲向贫民窟的赖斯基地。然而到达后，发现那里已经被丧尸占领。原来，为了独享逃生的机会，赖斯不惜将丧尸引入自己的老巢，这无疑是断了后路，手下一个个都被感染。这足以证明他的残忍。但克兰也是一个狠角色。他穿越了充满夜魔的下水道，与夜魔相比，克兰简直就是一个超人。之后，他又徒手攀爬高楼大厦，再次与赖斯对峙。赖斯突然发起进攻，但克兰迅速反应，不到一个回合就将匕首插入赖斯的腹部。赖斯终于倒下，而克兰还想上前说话，却被赖斯偷袭，差点被推入深渊。最终，克兰利用匕首成功反杀赖斯，看着他坠落后，狠狠地骂了一句，然后爬了上来。
此时，GRE的直升机也赶到了。他们告诉克兰，只要交出研究资料，他们也可以既往不咎地将他带出哈兰。但克兰早已看清了GRE的真实面目，拒绝了他们的提议。GRE的直升机只能无奈离开。
突然，无线电那头传来卡姆登博士的声音，他表示生物样本的分析取得了巨大的成功，只需要克兰带回泽雷博士的资料，解药的研制就指日可待了。这让克兰仿佛卸下了沉重的负担，长舒了一口气。他的目光最后聚焦在落日的余晖上......
最后的曙光
至此《消逝的光芒》本体内容的剧情到这里就结束了
尾声
最后我想说，无论是因为游戏中复杂到让人头晕眼花的操作感到退缩，或是对游戏内那些骇人丧尸的恐惧让你犹豫不决
我仍然建议你给自己一个机会，重新尝试《消逝的光芒》这款游戏。毕竟，无论多么精彩的剧情解说，都无法替代自己亲身体验一遍游戏所带来的真实感受。